No HNSC a água afetou os setores de Emergência, setor de Arquivo, Manutenção, Lavanderia e a Caldeira, que ficaram submersos. Alguns equipamentos foram levados para os andares de cima (o que foi possível).

Um fato interessante é que os doentes vinham de helicópteros, que pousavam e decolavam no pátio da catedral e depois eram levados de barco para o hospital.

Nesse período as clausuras que moravam as Irmãs foram abertas para abrigar médicos, funcionários e suas famílias, já que as enfermarias ficaram superlotadas de desabrigados.

Durante a enchente foi necessário instalar no hospital um gerador de 90kwa. Com a falta de energia na cidade, os médicos e anestesistas de plantão eram chamados por aparelhos walkie-talkie.